Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CHAF1AQ13111 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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