Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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