Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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