Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TROQ12816 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TROQ12816 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TROQ12816 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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