Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TFF3Q07654 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms