Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL9Q07325 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms