Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms