Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms