Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCA2P51531 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA2P51531 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms