Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCLMP48507 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCLMP48507 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCLMP48507 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms