Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATRXP46100 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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