Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP3K8P41279 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP3K8P41279 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP3K8P41279 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms