Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOLR1P15328 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms