Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BMP3P12645 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms