Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNB1P11230 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNB1P11230 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms