Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POP4O95707 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POP4O95707 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POP4O95707 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POP4O95707 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POP4O95707 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POP4O95707 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POP4O95707 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms