Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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