Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP36Q9P275 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms