Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms