Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms