Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms