Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LPIN3Q9BQK8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms