Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms