Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGREF1Q99674 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms