Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms