Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC38A9Q8NBW4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms