Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD35Q8N283 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD35Q8N283 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms