Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P3H3Q8IVL6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms