Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SYT9Q86SS6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYT9Q86SS6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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