Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms