Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q6P435 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6P435 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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