Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPPQ6IPU0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPPQ6IPU0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms