Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms