Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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