Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms