Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDCD2Q16342 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms