Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ZFHX3Q15911 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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