Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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