Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF1AQ15573 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms