Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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ITGB3BPQ13352 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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