Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TROQ12816 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TROQ12816 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TROQ12816 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TROQ12816 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TROQ12816 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TROQ12816 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TROQ12816 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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