Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms