Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms