Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms