Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms