Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSRP3P50461 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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