Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGER3P43115 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms