Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC1P41238 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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