Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT20P35900 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT20P35900 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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KRT20P35900 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRT20P35900 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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