Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms